1.根腐病：根腐病也叫黑莖病。松果菊感染病害后，植株上部葉片出現萎蔫，甚至整株葉片干枯，病情嚴重時，根部變成褐色，直至全株死亡。防治這種病害常用的方法是：采用40％敵磺鈉可濕性粉劑1000倍液噴霧或澆灌病株，每隔3—5天噴施一次，噴施2—3次即可見效。
        2.黃葉病：當松果菊感染黃葉病時，植株葉色變黃，有的卷曲，生長緩慢，植株矮化，花朵出現畸形，顏色變淺。這種病害的特點是：植株在第1年染病后，第2年才會發生癥狀。我們應提前進行防治，通常噴施50%多菌靈可濕性粉劑500倍液或75%百菌清可濕性粉劑600倍液，每隔7-10天噴施一次，連續噴施2-3次。當發現病植株大部分枯黃時，要及時拔除，并集中銷毀，避免病情擴散。
        3.菜青蟲：菜青蟲啃食松果菊葉片，造成葉片孔洞，影響植株的生長發育。發現菜青蟲時可用2.5%高效氟氯氰菊酯乳油1000倍液進行噴霧防治，每隔7天噴施一次，一般噴施2-3次就可以了。
        4.松果菊花葉病(purple coneflower mosaic)
        幼葉現濃綠與淡綠相間花葉狀。成株發病新葉呈黃綠相嵌狀花葉，病葉小略皺縮，嚴重時葉片反卷，病株下部葉片逐漸黃枯。

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