1．生理病害  麝香百合栽培過程中的生理病害主要有盲花和花裂等。其發生原因和防止措施如下。
    (1)盲花  受害的花芽正常發育受阻，花蕾凋謝而枯萎。多數情況是由于密植及室內的光線不足，或日照時數短等原因。特別是5℃以下的低溫、氣溫急劇下降、晝夜溫差大以及土壤過干或過溫。要防止盲花現象的發生，就要設法避免上述情況的出現。
    (2)花裂  主要表現為花瓣分離開裂，多發生在氣溫驟變、干濕懸殊的時候。防止裂花就要盡量避免氣溫的急升急降，并注意澆水適時適量。
    2．軟腐病  主要危害葉、花、鱗莖，花瓣發病則產生橢圓形病斑；葉片發病則產生橢圓形、淡黃色、周圍黑褐色稍下凹的病斑；遇到雨天則莖葉上產生黑色小粒點，最后葉全部落下，造成植株死亡。防治方法：發現少量植株發病立即剪除或拔除，并將其燒毀或深埋，另外注意通風透光，增加植株抗病力。
    3．腐敗病、葉斑病  由病菌侵入鱗莖葉片引起。防治方法：如發病應每10～15天噴1次50％脫菌特600～1000倍液或40％滅菌丹500倍液。預防的主要措施是種植麝香百合的地塊不連作。
    4．刺足根螨  成螨乳白色，洋梨形。此螨在地下危害球根，一般先危害鱗莖的蒂部，逐漸擴展向上，被害部位變黑腐爛，嚴重時造成整林死亡。防治力法：鱗莖貯藏時注意通風和干燥，對受害的鱗莖，收獲后、貯藏前用40％三氯殺螨醇1000倍液浸泡2分鐘，可起到防治作用。 中國苗木網,m.cqhuayin.com
    5．蠐螬   常將麝香百合的根部咬斷，造成植物萎蔫以致死亡。防治方法：可用黑光燈誘殺成蟲，也可在花卉根部灌50％辛硫磷乳劑1000倍液，將其殺死。

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